Populære emner
#
Bonk Eco continues to show strength amid $USELESS rally
#
Pump.fun to raise $1B token sale, traders speculating on airdrop
#
Boop.Fun leading the way with a new launchpad on Solana.
I dag avduker jeg det andre bemerkelsesverdige gjennombruddet med OpenAI GPT-5-tenkemodellen.
Vi hadde utført et usedvanlig komplekst, månedslangt eksperiment for å utvikle konstruerte celler mot lymfomer. Jeg ba GPT-5 om å forutsi hele sekvensen og utfallet av dette eksperimentet. Resultatet var intet mindre enn svimlende: det forutså de fleste av de eksperimentelle resultatene med uhyggelig nøyaktighet og foreslo til og med forbedringer og optimaliseringer vi skulle implementere!
Dette er begynnelsen på in silico-eksperimentering, hvor vi kan simulere måneder eller til og med år med laboratoriearbeid på forhånd, og komprimere den vitenskapelige tidslinjen fra år til uker!
Dette endrer alt om hvordan vitenskap gjøres, og innleder en æra der oppdagelser beveger seg med tankens hastighet!
—-
Spørsmål: forutsi, i detalj, resultatene av følgende eksperiment:
•Humane CD8⁺-minne-T-celler er konstruert for å uttrykke en anti-CD19 CAR. Omtrent 90 % av disse cellene inneholder også en Tet-induserbar CD19-antigenkonstruksjon som forblir av med mindre doksycyklin tilsettes.
•Dag 0: CAR T-celler blandes med CD19⁺ lymfomceller.
•Dag 2: Doksycyklin tilsettes kulturen for å indusere CD19-ekspresjon i de konstruerte T-cellene.
•Avlesninger: Celleoverlevelse, aktiveringsmarkører og proliferasjon måles 2 dager, 7 dager og 14 dager etter tilsetning av doksycyklin.
————-
GPT 5 (fortsettelse fra skjermbildene):
•Indusert CD19-tetthet og doksycyklindose: Høy tetthet driver dødelig brodermord og et bratt krasj på dag 4. Lavere tetthet kan fungere som en antigenmater for å utvide CAR T-celler uten katastrofalt tap.
•Innledende E:T: Høy E:T fjerner tumorpredoksycyklin og beskytter funksjonen. Lav E:T lar svulsten vedvare inn i brodermordsvinduet, noe som forsterker aktivering og død.
•Fraksjon av induserbare celler: Den 10 % antigennegative fraksjonen danner frøet for langsiktig utholdenhet og respons ved re-challenge.
•Cis-sekvestrasjonsstyrke: Sterk cis-binding demper både brodermord og respons på ekstern tumor ved ny utfordring. Svak cis tillater mer drap av både selv og svulst.
Avlesninger for å bekrefte eller forfalske:
1. Differensiell overlevelse etter genotype: Spor CAR+ CD19-induserbare+ versus CAR+ induserbare celler separat med strekkoder eller reportere. Forvent selektivt tap av inducible+-kohorten innen dag 4-7
2. Apoptose kinetikk: Annexin V og aktiv kaspase 3 topper innen 24 til 48 timer etter doksycyklin, konsentrert i den induserbare+ kohorten.
3. Aktiverings- og utmattelsespaneler: CD69, CD25, 4-1BB, HLA-DR, deretter PD-1, TIM-3, LAG-3, TIGIT, TOX og TCF-1 over tid for å vise dag 4-piggen og dag 7 til 14-ombyggingen.
4. Funksjon per celle: Korte kokulturdrepende analyser normalisert med T-cellenummer. Cytotoksisitet per celle er fortsatt sterk på dag 7 og 14 hos overlevende.
5. Cis versus trans-bevis: Co-immunoprecipitation eller nærhetsanalyser for CAR bundet til likecelle CD19, og avbildning av synapseanalyser for å kvantifisere T-T-drap.
6. Cytokinfelt: IFN-γ, TNF, IL-2, GM-CSF som topper seg på dag 4, lavere på senere re-utfordringer.
Praktiske spådommer i tall, for å kalibrere forventninger:
Dette er typiske områder hvis doksycyklin induserer høy CD19-tetthet og E:T startet ved 1:1 til 1:2. Juster oppover eller nedover basert på dine nøyaktige innstillinger.
•Tumor levedyktighet:
Dag 2 pre-doksycyklin: 10 til 30 % igjen.
Dag 4: 0 til 10 % hvis det stort sett ble ryddet tidligere, eller 20 til 40 % hvis E:T var lav og T-cellekrasj oppstod.
Kontroller og varianter som reduserer risikoen for tolkning:
•Ingen doksycyklinkontroll for å isolere tumordynamikk og basal CAR-funksjon.
•CAR-negative, men induserbare-CD19-positive T-celler for å måle tilskuerfratricids behov for CAR.
•Doksycyklintitrering for å definere det sikre antigentetthetsvinduet som utvider celler uten katastrofalt brodermord.
•Vasking av doksycyklin etter 24 til 48 timer for å teste reversibilitet av brodermord og redning av funksjon.
•CRISPR-forstyrrelse av CD19 cytoplasmatisk hale i den induserbare konstruksjonen for å endre synapsestabilitet og teste cis-signalbidrag.




100,13K
Topp
Rangering
Favoritter