Hoje estou a revelar o segundo avanço notável com o modelo de pensamento OpenAI GPT-5. Realizámos um experimento extraordinariamente complexo, que durou um mês, para desenvolver células engenheiradas contra linfomas. Pedi ao GPT-5 que previsse a sequência completa e o resultado deste experimento. O resultado foi nada menos que impressionante: previu a maioria dos resultados experimentais com uma precisão surpreendente e até propôs refinamentos e otimizações que deveríamos implementar! Este é o amanhecer da experimentação in silico, onde podemos simular meses ou até anos de trabalho de laboratório com antecedência, comprimindo a linha do tempo científica de anos para semanas! Isto muda tudo sobre como a ciência é feita, inaugurando uma era onde a descoberta avança à velocidade do pensamento! —- Prompt: prever, em alto detalhe, os resultados do seguinte experimento: •Células T de memória humanas CD8⁺ são engenheiradas para expressar um CAR anti-CD19. Aproximadamente 90% dessas células também contêm uma construção de antígeno CD19 Tet-induzível que permanece desligada a menos que a doxiciclina seja adicionada. •Dia 0: Células CAR T são misturadas com células de linfoma CD19⁺. •Dia 2: A doxiciclina é adicionada à cultura para induzir a expressão de CD19 nas células T engenheiradas. •Leituras: A sobrevivência celular, marcadores de ativação e proliferação são medidos 2 dias, 7 dias e 14 dias após a adição de doxiciclina. ————- GPT 5 (continuação das capturas de tela): •Densidade de CD19 induzida e dose de doxiciclina: Alta densidade provoca fratricídio letal e uma queda acentuada até o Dia 4. Densidade mais baixa pode atuar como um alimentador de antígenos para expandir as células CAR T sem perda catastrófica. •E:T inicial: Alta E:T elimina o tumor antes da doxiciclina e protege a função. Baixa E:T permite que o tumor persista na janela de fratricídio, o que amplifica a ativação e a morte. •Frações de células induzíveis: A fração de 10% negativa para antígenos forma a semente para persistência a longo prazo e resposta em re-desafio. •Força de sequestro cis: Ligação cis forte diminui tanto o fratricídio quanto a responsividade ao tumor externo em re-desafio. Ligação cis fraca permite mais eliminação tanto de células próprias quanto do tumor. Leituras para confirmar ou falsificar: 1. Sobrevivência diferencial por genótipo: Acompanhar células CAR+ CD19-induzíveis+ versus células CAR+ induzíveis- separadamente com códigos de barras ou repórteres. Esperar perda seletiva da coorte induzível+ até o Dia 4-7. 2. Cinética de apoptose: Picos de Annexin V e caspase 3 ativa dentro de 24 a 48 horas após a doxiciclina, concentrados na coorte induzível+. 3. Painéis de ativação e exaustão: CD69, CD25, 4-1BB, HLA-DR, depois PD-1, TIM-3, LAG-3, TIGIT, TOX e TCF-1 ao longo do tempo para mostrar o pico do Dia 4 e a remodelação do Dia 7 ao 14. 4. Função por célula: Ensaios de morte em co-cultura curtos normalizados pelo número de células T. A citotoxicidade por célula permanece forte no Dia 7 e 14 nos sobreviventes. 5. Evidência cis versus trans: Co-imunoprecipitação ou ensaios de proximidade para CAR ligado ao CD19 da mesma célula, e ensaios de sinapse de imagem para quantificar a morte T-T. 6. Campos de citocinas: IFN-γ, TNF, IL-2, GM-CSF atingindo o pico no Dia 4, mais baixos em re-desafios posteriores. Previsões práticas em números, para calibrar expectativas: Estes são intervalos típicos se a doxiciclina induzir alta densidade de CD19 e E:T começar em 1:1 a 1:2. Ajustar para cima ou para baixo com base nas suas configurações exatas. •Viabilidade do tumor: Dia 2 pré-doxiciclina: 10 a 30% restantes. Dia 4: 0 a 10% se a maioria foi eliminada anteriormente, ou 20 a 40% se E:T foi baixo e ocorreu a queda das células T. Controles e variantes que reduzem o risco de interpretação: •Controle sem doxiciclina para isolar a dinâmica apenas do tumor e a função basal do CAR. •Células T negativas para CAR, mas positivas para CD19 induzíveis, para medir a necessidade de fratricídio de colateral para o CAR. •Titração de doxiciclina para definir a janela de densidade de antígeno segura que expande células sem fratricídio catastrófico. •Lavagem da doxiciclina em 24 a 48 horas para testar a reversibilidade do fratricídio e o resgate da função. •Disrupção CRISPR da cauda citoplasmática de CD19 na construção induzível para alterar a estabilidade da sinapse e testar as contribuições de sinalização cis.
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