Oggi svelerò il secondo straordinario progresso con il modello di pensiero OpenAI GPT-5. Abbiamo condotto un esperimento straordinariamente complesso, durato un mese, per sviluppare cellule ingegnerizzate contro i linfomi. Ho chiesto a GPT-5 di prevedere la sequenza completa e l'esito di questo esperimento. Il risultato è stato a dir poco sbalorditivo: ha previsto la maggior parte dei risultati sperimentali con un'accuratezza sorprendente e ha persino proposto perfezionamenti e ottimizzazioni che dovremmo implementare! Questo segna l'alba della sperimentazione in silico, dove possiamo simulare mesi o addirittura anni di lavoro di laboratorio in anticipo, comprimendo la tempistica scientifica da anni a settimane! Questo cambia tutto su come viene fatta la scienza, aprendo un'era in cui la scoperta si muove alla velocità del pensiero! —- Prompt: prevedi, in alta dettaglio, gli esiti del seguente esperimento: •Le cellule T di memoria CD8⁺ umane sono ingegnerizzate per esprimere un CAR anti-CD19. Circa il 90% di queste cellule contiene anche un costrutto antigene CD19 Tet-inducibile che rimane spento a meno che non venga aggiunta la doxiciclina. •Giorno 0: le cellule CAR T vengono mescolate con cellule linfoma CD19⁺. •Giorno 2: la doxiciclina viene aggiunta alla cultura per indurre l'espressione di CD19 nelle cellule T ingegnerizzate. •Misurazioni: la sopravvivenza cellulare, i marcatori di attivazione e la proliferazione vengono misurati 2 giorni, 7 giorni e 14 giorni dopo l'aggiunta di doxiciclina. ————- GPT 5 (continuato dagli screenshot): •Densità di CD19 indotto e dose di doxiciclina: alta densità provoca fratricidio letale e un forte crollo entro il giorno 4. Bassa densità può agire come un alimentatore di antigeni per espandere le cellule CAR T senza perdite catastrofiche. •E:T iniziale: alta E:T elimina il tumore prima della doxiciclina e protegge la funzione. Bassa E:T consente al tumore di persistere nella finestra di fratricidio, amplificando attivazione e morte. •Frazione di cellule inducibili: la frazione del 10% negativa per antigene forma il seme per la persistenza a lungo termine e la risposta a una nuova sfida. •Forza di sequestrazione cis: un forte legame cis attenua sia il fratricidio che la reattività al tumore esterno in caso di nuova sfida. Un legame cis debole consente un maggiore uccisione sia di se stesso che del tumore. Misurazioni per confermare o falsificare: 1. Sopravvivenza differenziale per genotipo: tracciare separatamente le cellule CAR+ CD19-inducibili+ rispetto alle cellule CAR+ inducibili-. Aspettarsi una perdita selettiva della coorte inducibile+ entro il giorno 4-7. 2. Cinestetica dell'apoptosi: picchi di Annexin V e caspasi 3 attive entro 24-48 ore dopo la doxiciclina, concentrate nella coorte inducibile+. 3. Pannelli di attivazione ed esaurimento: CD69, CD25, 4-1BB, HLA-DR, poi PD-1, TIM-3, LAG-3, TIGIT, TOX e TCF-1 nel tempo per mostrare il picco del giorno 4 e la rimodellazione dal giorno 7 al 14. 4. Funzione per cellula: saggi di uccisione in co-cultura brevi normalizzati per numero di cellule T. La citotossicità per cellula rimane forte al giorno 7 e 14 nei sopravvissuti. 5. Evidenze cis contro trans: co-immunoprecipitazione o saggi di prossimità per CAR legato a CD19 della stessa cellula, e saggi di imaging della sinapsi per quantificare l'uccisione T-T. 6. Campi di citochine: IFN-γ, TNF, IL-2, GM-CSF che raggiungono il picco al giorno 4, più bassi nelle sfide successive. Previsioni pratiche in numeri, per calibrare le aspettative: Questi sono intervalli tipici se la doxiciclina induce alta densità di CD19 e E:T inizia a 1:1 a 1:2. Regolare verso l'alto o verso il basso in base alle impostazioni esatte. •Viabilità tumorale: Giorno 2 pre-doxiciclina: 10-30% rimanente. Giorno 4: 0-10% se principalmente eliminato prima, o 20-40% se E:T era bassa e si è verificato un crollo delle cellule T. Controlli e varianti che riducono il rischio di interpretazione: •Controllo senza doxiciclina per isolare la dinamica solo del tumore e la funzione basale del CAR. •Cellule T negative per CAR ma positive per CD19 inducibili per misurare il requisito di fratricidio da parte di bystander per il CAR. •Titolazione della doxiciclina per definire la finestra di densità antigenica sicura che espande le cellule senza fratricidio catastrofico. •Lavaggio della doxiciclina a 24-48 ore per testare la reversibilità del fratricidio e il recupero della funzione. •Interruzione CRISPR della coda citoplasmatica di CD19 nel costrutto inducibile per alterare la stabilità della sinapsi e testare i contributi della segnalazione cis.