Vapowanie może być gorsze niż palenie papierosów dla zdrowia mitochondriów. Badania in vitro (wstępne dane z laboratorium dr. Bena Bikmana) sugerują, że aerozole z e-papierosów stwarzają znaczące ryzyko dla mitochondriów, zwiększając ilość reaktywnych form tlenu i osłabiając ich zdolność do przekształcania tlenu w energię (ATP). Dym papierosowy również szkodzi mitochondriom, powodując oporność na insulinę i zakłócając produkcję energii. Jednak przy porównywalnych dawkach, vapowanie jest bardziej szkodliwe, mimo że jest reklamowane jako "bezpieczniejsza" alternatywa.