Vapen kan slechter zijn voor de mitochondriale gezondheid dan sigaretten. In vitro studies (voorlopige gegevens van het lab van Dr. Ben Bikman) suggereren dat e-sigaret aerosolen aanzienlijke risico's voor mitochondriën met zich meebrengen, waardoor reactieve zuurstofsoorten toenemen en hun vermogen om zuurstof om te zetten in energie (ATP) wordt aangetast. Sigarettenrook schaadt ook mitochondriën, wat leidt tot insulineresistentie en verstoring van de energieproductie. Echter, bij gelijkwaardige doses is vapen schadelijker, ondanks dat het wordt gepromoot als een "veiliger" alternatief.