Vaping mungkin lebih buruk daripada rokok untuk kesehatan mitokondria. Studi in vitro (data awal dari laboratorium Dr. Ben Bikman) menunjukkan aerosol rokok elektrik menimbulkan risiko signifikan bagi mitokondria, meningkatkan spesies oksigen reaktif dan merusak kemampuan mereka untuk mengubah oksigen menjadi energi (ATP). Asap rokok juga merusak mitokondria, menyebabkan resistensi insulin dan mengganggu produksi energi. Namun, pada dosis yang cocok, vaping lebih merugikan, meskipun dipasarkan sebagai alternatif yang "lebih aman".