Le vapotage pourrait être pire que les cigarettes pour la santé mitochondriale. Des études in vitro (données préliminaires du laboratoire du Dr Ben Bikman) suggèrent que les aérosols de cigarette électronique présentent des risques significatifs pour les mitochondries, augmentant les espèces réactives de l'oxygène et altérant leur capacité à convertir l'oxygène en énergie (ATP). La fumée de cigarette nuit également aux mitochondries, provoquant une résistance à l'insuline et perturbant la production d'énergie. Cependant, à des doses équivalentes, le vapotage est plus néfaste, malgré le fait qu'il soit commercialisé comme une alternative "plus sûre".