國務院的政治事務局是其最具CIA色彩的部門。JFK檔案顯示48%的國務院政治事務人員是CIA的臥底。比爾·伯恩斯曾是政治事務的負責人，後來成為CIA局長。維多利亞·紐蘭曾是政治事務的負責人，現在在NED工作。